Gli alimenti rappresentano, per molte specie di microrganismi, un ambiente molto adatto per la loro sopravvivenza e per la loro riproduzione. E bene però fare una premessa: non tutti i microrganismi sono nocivi, anzi alcuni sono molto utili per i processi tecnologici e vengono aggiunti intenzionalmente per produrre alimenti e bevande, come pane, pizza, formaggi, salame, vino e birra.